Co do formy wyświetlania artykułów na stronie, wejdź do górne menu i po kolei "Menu" następnie "mainmenu", edytuj pierwszą pozycję, powinno to być "Start"
Poczytaj opisy przy:
" # wprowadzeń "
" # wstępów "
" Szpalty "
" # odsyłaczy "
U mnie ustawiłem na 1, 2, 1, 1

Jeśli chodzi o rozjazdy w IE, myślę że to wina zegarka (wyświetla się dokładnie po środku tabeli)nie bawiłem się nim to nie wiem, ale wygląda na to że ma ustawioną jakąś stałą szerokość a on sam jest wyśrodkowany.
Podobnie "google pagerank".
Spróbuj wyłączyć te dwie rzeczy i zobaczymy.

Edit
Piszesz że mod imieniny wyłączyłeś, to czemu nadal jest na stronie ?
W Operze to on jest źle wypozycjonowany a w Firefox dziwnie wygląda.

Problem z rozjazdem jak udało mi się zauważyć podowuje moduł imieniny i moduł "najbardziej popularne"
Moduł imieniny teraz nie wygląda tak jak powinien bo próbowałem go wyedytować żeby nie rozszerzał tej lewej ramki jednak moje wszystkie starania poszły na marne

Moduł zegar nie powoduje żadnych błędów

Pozdrawiam